Zona Jaman Purba
Koleksi yang dipamerkan berawal dari mulainya pembentukan alam yang terdiri dari:
- Koleksi Geologika(koleksi batuan), adalah koleksi batuan yang bisa dimanfaatkan manusia sebagai bahan perhiasan maupun jenis batuan yang dimanfaatkan untuk keperluan industri. Koleksi batuan yang dipamerkan adalah Batuan Beku, Sedimen dan Batuan Metamorf.
- Koleksi Biologika, adalah koleksi yang berasal dari makhluk hidup yang terpendam di dalam tanah yang kemudian berubah zat kimianya dan menjadi keras seperti batu. Koleksi yang dipamerkan antara lain duplikat fosil manusia, fosil gading gajah purba, fosil kepala kerbau, fragmen fosil gigi geraham gajah purba, fosil kulit penyu, duplikat fosil Bofidae.
Zona jaman purba juga dilengkapi dengan hasil teknologi manusia prasejarah antara lain:
Peninggalan masa Paleolithik berupa kapak genggam, peninggalan masa Neolithik berupa kapak persegi dan kapak lonjong serta manik-manik dan peninggalan masa perundagian berupa kapak corong, mata tombak, nekara, moko dan surya stambha.
Kapak Je
Asal: Irian.
Merupakan salah satu peninggalan masa Neolithik yang hingga saat ini masih digunakan walaupun dalam fungsi yang berbeda
koleksi fosil binatang purba
Merupakan fosil Bovidae (sejenis sapi purba) berasal dari nganjuk berusia sekitar 700 tahun. merupakan fosil binatang yang masih cukup muda, belum memfosil sempurna
